Os Laboratórios do ISPOCA tem por missão o apoio ao Ensino e à Investigação disponibilizando um vasto, diversificado e actualizado materiais de ensino e aprendizagem em áreas como saúde e engenharias. Funciona em regime de planificação docente o que permite, que cada docente acompanhado de seus estudantes em grupos de estudos possam utilizar, consultar sob orientação de aulas práticas os meios disponiveis.
Actualmente o ISPOCA tem dois laboratórios: um de fisiologia e outro de materiais electricos.